金相顯微鏡屬于較為精密的光學儀器，所以使用者應注意對金相顯微鏡系統進行日常維護和保養，有關注意事項如下：
1、實驗室首先應具備三防條件，具體為防震（即遠離震源）、防潮（即使用空調或干燥器等）、防塵（即地面鋪上地板）；電源一般為220V±10%，50Hz；溫度適宜在 0℃—40℃ 范圍內。
2、金相顯微鏡亮度調整切不可忽大、忽小，也不可過于明亮，應盡量避免影響燈泡的使用壽命，同時應懂得如何保護自己的視力。
3、當載物臺墊片圓孔的中心位置遠離物鏡的中心位置時，不要隨意切換物鏡，以避免劃傷物鏡。
4、在進行金相顯微鏡調焦操作時，應注意不要使物鏡碰到樣品，以更好的避免損傷物鏡。
5、所有功能等的切換，動作都要盡量輕一些，且應到位。
6、關機時謹記，須將亮度調到較小。
7、非專業人員不能隨意調整照明系統（即燈絲位置等），以避免影響成像的質量。
8、更換鹵素燈時，要注意避免高溫，以免灼傷皮膚等；同時應注意不要用手直接接觸鹵素燈的玻璃體。
9、不經常使用的光學部件必須放置于干燥的器皿內存放。
10、在使用完金相顯微鏡后，應將物鏡通過調焦機構調整到較低的狀態。
11、關機不使用時，注意不要立即遮蓋防塵罩，待其冷卻后再遮蓋，避免因機身過熱引發火災等。
12、非專業人員不應隨意擦拭物鏡及光學部件等。建議目鏡可用脫脂棉簽蘸1:1比例(無水酒精：乙mi)混合液體，甩干后進行擦拭，注意，不要使用其他液體，以避免損傷到目鏡。
